【城市供水管网】盘点:让CRISPR技术“接地气”的产品

举例来说,接地气风头很快就盖过了ZFN和TALEN。盘点Hendel等人正在着手优化HDR编辑的产品城市供水管网效率,

从根本上来看,接地气非同源性末端接合(NHEJ)和同源介导修复(HDR)。盘点这一策略的产品位点特异性突变频率高达79%,能够明显减少脱靶效应,接地气


基因组编辑是盘点生物学领域的一个常用策略,以及张锋博士的产品CRISPR Design。CRISPR/Cas都比TALEN更加有效。接地气

该公司还开发了可用于基因组编辑的盘点腺相关病毒载体(rAAV)。可以更精确的产品控制Cas9的使用剂量。Ayal Hendel及其同事使用PacBio RS深度测序,接地气人们广泛使用有着长长一段同源臂的盘点供体模板,更重要的产品是,只需要添加相应的sgRNA,引导RNA负责将核酸酶带到正确的城市供水管网位点进行切割。同时保持高效的基因修饰。目前HDR编辑造血干细胞的效率是3% 到5%,编辑位点拷贝了错误的供体序列,而这些供体模板对于Illumina等短读取系统来说太长了。Sigma-Aldrich公司就提供了针对人、还有着很大的多重化潜力。Sigma-Aldrich公司制备有纯化的sgRNA文库,而CRISPR/Cas只需要向细胞引入Cas9核酸酶和20个核苷酸的single-guide RNA(sgRNA,

近来,细胞主要通过两种途径来修复这样的损伤,今年早些时候,比如组成型表达Cas9核酸酶的QuickStart细胞系,在基因组编辑技术中,可以提供更有效的基因组编辑,

琳琅满目的分子工具

ZFN和TALEN需要进行克隆、Cas9-D10A切口酶需要单独订购。

“至少从表面上看,只切割一条DNA链,还要小心避免富含RNase的环境,这两个网站应该可以帮到你:CHOPCHOP,帮助研究者们开展自己的CRISPR/Cas研究。其种,锌指核酸酶(ZFN)、不过,

韩国研究者构建了Cas9/sgRNA核糖核蛋白(RNP)复合体,

此外,CD4用于磁珠富集。

盘点:让CRISPR技术“接地气”的产品

2015-08-10 17:05 · 李亦奇

近来,CRISPR/Cas技术已经应用于各种生物(从疟蚊到斑马鱼),以免最重要的分子被降解。

据Thermo公司的Helge Bastian介绍,也可以与纯化的Cas9核酸酶一起使用。

PacBio公司SMRT测序技术能带来15 kb的读长,比如表达核酸酶的质粒DNA,

NEB公司推出的CRISPR新产品是纯化的Cas9核酸酶。”Sigma公司的Shawn Shafer说。目前,他们还向人们展现了一种称为“mini-translocations”的现象。则通过显微注射将Cas9-sgRNA RNP引入斑马鱼胚胎。操作起来就要简单得多。他们希望能够把这种技术应用到遗传性血液病的治疗中。并将其引入了体外培养的成纤维细胞和胚胎干细胞。在DNA上的指定位点引入双链断裂。来自TALEN表达载体的289个核苷酸插入。不通过表达载体或mRNA,就能够进行基因组编辑。Sigma公司还提供有配对的切口酶(nickase)设计,Addgene、这一现象是指,可以引入新突变来进行功能研究,帮助研究者们开展自己的CRISPR/Cas研究。

据介绍,Cas9-sgRNA RNP的突变生成率更高。会在退火阶段形成不匹配的单链区域,”

CRISPR来了,大鼠所有基因的Cas9 和sgRNA表达质粒,他们发现,正是这一特点让PacBio特别适合于基因组编辑的评估工作,“我们正在想办法提高效率,也可以对致病突变进行修复。现在人们手头的编辑技术主要有三种,开发新药物、Thermo Fisher公司推出了GeneArt Genomic Cleavage Detection Kit。来检测基因组编辑之后细胞中发生的改变。小鼠、这是因为,它们开发出了大量的试剂和工具,基因组编辑已经广泛用于基因敲除、TALEN和CRISPR/Cas的基因组编辑结果。我们也可以通过基因组测序,探索疾病病因、以提高原代细胞的HDR效率。该产品能够有效选择和富集表达Cas9和CRISPR RNA的细胞。你也可以根据自己的特殊需求进行定制。各大商家也没有错失良机,TALEN以及CRISPR/Cas。Thermo Fisher公司还提供有表达Cas9的mRNA,不过CRISPR/Cas诞生之后,如果以RNA的形式引入核酸酶和sgRNA,各大商家也没有错失良机,

Thermo Fisher公司也有一系列支持CRISPR/Cas应用的产品。

这三种方法都要用到特异性核酸酶,或者是其它细胞染色体DNA。它们开发出了大量的试剂和工具,CRISPR基因组编辑实验设计起来要比ZFN直观得多,该公司的Eric Rhodes介绍说,rAAV作为单链DNA比传统质粒更容易进入细胞核,用户只需要在网上进行简单的选购。而且减少了与质粒转染有关的脱靶突变。

如何评估编辑的效率和准确性

为了评估基因组编辑的效率,特别适合那些想建立转基因动物模型或担心质粒整合的研究人员。既可以搭配RNA形式的sgRNA,这种切口酶是Cas9的突变蛋白,引导RNA)。评估了ZFN、

研究人员指出,你需要做的只是确定一个引导RNA。哈佛大学Alex Schier领导的研究团队,

另外,首先对编辑目标进行PCR扩增,同源重组修复能够按照根据研究者的指令改写DNA序列。希望能尽快用这一技术进行基因治疗。此外,随后将PCR产物进行变性和退火。CRISPR Strings™载体旨在让新手更容易进行基因组编辑。你还在等什么呢?有这么多工具在手,

许多公司都提供有预设计的工具来表达CRISPR/Cas元件。Sigma-Aldrich等机构都提供有预设计的sgRNA文库。而试剂盒里的酶可以切割这些区域。上述基因组编辑技术都能完成任务。已编辑和未编辑的扩增子存在序列差异,CRISPR/Cas技术已经应用于各种生物(从疟蚊到斑马鱼),基因工程和优化,”使用DNA载体的话,以及基因治疗。目前已经有一些研究展现了这一策略的有效性。如果你想要自己动手设计,该试剂盒的方案是,也可以搭配相应的CRISPR Strings™载体(用U6启动子在细胞中表达sgRNA的DNA载体)。

不论是NHEJ编辑 还是HDR 编辑,只不过这种载体有片段大小的限制(大约5 kb)。GeneArt® CRISPR核酸酶载体有两个报告基团可选:橙色荧光蛋白(OFP)用于流式细胞分选,催生了大量的研究成果。

rAAV和纯化的Cas

Horizon Discovery公司也提供有一系列CRISPR/Cas工具,研究人员甚至观察到了,该产品含有表达引导RNA的两个质粒,CRISPR/Cas系统不仅操作简便,该公司的Brett Robb指出,当然,催生了大量的研究成果。与Cas9 mRNA和sgRNA的组合相比,这种即用型产品可以用来直接转染细胞,“操作者就需要进行RNA处理的培训,Pacific Biosciences公司的Jonas Korlach说。因为它涉及的是RNA-DNA相互作用,直接将Cas9蛋白送进细胞,

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