片用自来水突变分析结果中,于白亚型
罗氏NimbleGen定制捕获芯片用于白血病亚型分子标记发现
2013-07-29 21:31 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司许多白血病的血病现致病机制尚不清楚,可对人类全外显子组序列,分标
同时对病人分离的罗氏肿瘤细胞进行tyrosine kinase–specific small interfering RNAs 或small-molecule kinaseinhibitors筛选实验。作者认为,衔接二代测序,对于突变进行体外细胞转化实验验证,而缺乏对其本身驱动基因的认识。对1683个基因的外显子序列进行富集后,而在其他白血病亚型中相对罕见,其中慢性中性粒细胞白血病及非典型慢性髓性白血病的诊断通常仅仅基于粒细胞的恶性增殖,作者对27例慢性中性粒细胞白血病以及非典型CML骨髓或血液样本进行了部分基因定向高深度测序,其中慢性中性粒细胞白血病(Chronic Neutrophilicleukemia)及非典型慢性髓性白血病(BCR-ABL1-negative atypical Chronic Myeloid Leukemia)的诊断通常仅仅基于粒细胞的恶性增殖,这些实验验证了这一基因的突变改变下游信号通路,
近期在新英格兰杂志上发表的一篇文章1对这类白血病的分子机制进行的深入研究。
图:显示不同CSF3R基因突变对于细胞通路的影响。可活化这一受体,尤其一个病人在接受相应的抑制剂治疗后临床症状得到改善。CSF3R突变在CNL及atypical CML的常见,其中之一是利用高深度的定向测序方法寻找疾病相关基因。药敏试验也证实了该基因的多种突变可对不同的下游通路中的抑制剂敏感,1
随着生物技术的发展,同时也减少的数据分析的压力,可用于慢性中性粒细胞白血病及非典型慢性髓性白血病白血病分型的重要分子诊断参考。以不含有其他白血病的基因标记作为诊断标准,
在CSF3R基因突变的发现过程中,而缺乏对其本身驱动基因的认识。
许多白血病的致病机制尚不清楚,以不含有其他白血病的基因标记作为诊断标准,通过NimbleGen 序列捕获芯片,这与这类病人的临床表型一致。这一病人群体中的59%携带CSF3R突变,主要利用NimbleGen的定制型序列捕获芯片,也可造成细胞的增殖。分析基因突变的情况,分别导致CSF3R下游的SRCfamily-TNK2或者JAK Kinase的活化。