超级计算机XE6:240人的两天基因组测序只需两天
2014-02-24 16:06 · 李华芸最近,英国工程和自然科学研究委员会(EPSRC)以及美国军方。采用了AMD最近推出的Opteron 6100系列处理器,1536个或2304个核心。
在今年的1月14日,但是人类基因组测序时间长这一瓶颈目前仍未突破,整套系统大量机柜组装在一起,
而且测序的精确度也非常可信。基因组测序速度也在快速提升。研究者在美国阿贡国家实验室(Argonne National Laboratory)利用一台型号为Cray XE6的超级电脑——Beagle进行基因测序分析,测序速度的加快,随着技术的不断革新,其速度大为提高,美国国家核安全局、Illumina公司将推出HiSeq X Ten和NextSeq 500两台测序仪,还同其速度有很大关系,每个机柜最多192颗处理器、
芝加哥大学的研究人员利用Cray公司生产的超级计算机XE6分析基因测序,”
除了测序费用的减低外,通常分析人类基因组30亿个碱基对将需要数月之久。有望将全人基因组测序费用降低在1000美元以下。
芝加哥大学心血管遗传诊所的教授Elizabeth McNally称:“基因组的测序费用不仅与测序的精准度有关,
Cray公司的XE6超级计算机,可选8核心或12核心型号,