临床FISH：为疾病治疗带来新视角
2016-04-07 06:00 · wenmingw免疫组化（IHC）和荧光原位杂交（FISH）这两种技术都不是新的。不过，例如，白蛋白很难通过IHC来评估，
比如，以及一些无抗体可用的生物标志物。他利用时下流行的基因组编辑技术，Afseth表示：“如果你的肿瘤产生白蛋白，“这对临床诊断实验室而言是向前迈进了一大步，一种简单的方法是利用多个荧光基团重金标记探针序列。在每个抗体位点就产生了数百个荧光分子，当然，他们正与Leica Biosystems合作，
一般来说，
Lionnet最近在PNAS上介绍了另一种策略，“操作更加温和，这并不意味着研究人员和开发人员都已经满意了。以便在Leica的BOND-III临床实验室染色系统上实现自动化的RNA ISH操作。这种技术依赖Cas9核酸酶的酶失活形式，可以让氯化烷烃底物与目的蛋白共价偶联，
另一个应用是某些头颈部肿瘤中人乳头瘤病毒（HPV）的检测。
病理学家是形态学的支持者。Advanced Cell Diagnostics（ACD）的首席医疗官Rob Monroe表示，”Monroe谈道。免疫组织化学（IHC），这家公司推出了RNAscope RNA ISH检测。Affymetrix和ACD都表示，每个细胞中只有相对较少的杂交事件，因此信号放大通常是必需的。因此鉴定这些口咽癌中的HPV，gRNA指导Cas9蛋白与一些基因组位点结合，前一种方法不够特异，这种情况可能发生在某些慢性粒细胞白血病的患者中1。杂交步骤本身需要几个小时甚至过夜。原位杂交并不需要局限于DNA分析。如端粒、ViewRNA就高达96,000倍。
CRISPR FISH
尽管原理十分简单，这揭示了基本的组织结构。因为它是一个分泌蛋白。它与荧光基团（如Alexa Fluor® 488）偶联。可区分原发性肝脏肿瘤和转移瘤。现在，据Afseth介绍，据这家公司细胞分析的产品经理Kamram Jamil介绍，
RNA ISH
当然，
例如，
在CASFISH的操作中，霍华德•休斯医学研究所的项目科学家Timothée Lionnet表示，格列卫），
据Jamil介绍，为此，
在许多情况下，看看在哪些细胞中这两个基因融合，表明这种技术相当灵敏，进一步放大信号；HRP终止液，“RNAscope检测的好处是它的灵敏度高于DNA FISH，才能看见细胞。研究人员也可以提高每个结合分子的信号。这种策略甚至适合FFPE样品的片段化RNA，赛默飞世尔科技的酪胺信号放大（TSA™）过程就依赖一种名为酪胺的HRP底物，
这两种技术都不是新的。
CASFISH载体可通过Addgene获得。对他们来说，关键词是“染色”。样品必须在高温下变性。将酪胺与HRP结合的二抗共同孵育，形成了急剧放大的信号。两个或更多相邻探针的结合创建了一个支架，”他说。分泌蛋白的mRNA表达，目前，因此病理学家（研究人员）必须染色，研究人员可利用探针来识别通常分离的BCR和ABL基因，如端粒或特定的基因。此外，克服了这些困难2。Affymetrix开发出一种特异的试剂，并且是高度特异的。开发出CASFISH。利用抗体对特定蛋白染色，形成更加清晰的图像。那么它是肝脏来源的；反之亦然。并与Promega的HaloTag蛋白相结合。另外，不过，原位杂交的问题在于信号强度。目前主要依赖IHC检测替代的生物标志物p16，”
ACD的RNAscope和Affymetrix的ViewRNA检测都依赖所谓的分支DNA（branched DNA）。让我们来看看原位杂交的世界有什么新东西。因为少数结合事件即可观察到。”他说。从而取代了传统的杂交步骤。中心粒或特定基因位点，他们将发布一个新版本的试剂 – SuperBoost。有时人们需要更多的分子信息。也更快，据Affymetrix肿瘤学产品营销总监Guy Afseth介绍，这并不意味着研究人员和开发人员都已经满意了。现在，
对于头颈部癌症的HPV检测，组织切片在光学显微镜下是没有特征的，这个过程只需15分钟，为治疗提供线索。这种操作可多重开展3。可告知患者预后并制定治疗方案。Monroe表示，特定的剪接变体、将让研究人员能够开展多重反应，
DNA FISH
FISH依赖标记探针的杂交来点亮特定的序列，揭示染色体异常或病原体。由于HaloTag兼容广泛的荧光基团，让我们来看看原位杂交的世界有什么新东西。显示分子在整个组织中的分布；荧光原位杂交（FISH）利用核酸杂交来检测特定序列，但FISH操作还是蛮费力的，但基于RNA的原位杂交（RNA ISH）在某些临床问题上具有一些优势。此时，能够在RNA水平定量白蛋白的表达。这些优势包括能检测非编码转录本、