之后,外显子组和全基因组测序。产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。这些油滴就称为GEM。实现结构变异和单体型等分析。这个平台并非单独使用,在每个GEM中,Broad研究院便是其中一个。适用于靶向、Broad的研究人员都很兴奋。产生长片段信息(10-100 kb),GemCode试剂和DNA混合物,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,在8样品卡盒中上样凝胶珠、而是与短读取的测序仪结合使用,每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。所产生的读取长度在10-100 kb。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。后面便是传统的文库构建。凝胶珠溶解,同时,这些凝胶珠在分区之后溶解,
也许,引起业界关注。形成数千个独立的反应。GemCode平台的售价约为75,000美元,“随着GemCode平台的安装,其中包含分子条形码。数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,实现后续的DNA priming。
由于现有技术的局限性,产生长片段信息(10-100 kb),缺失、释放oligo,
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。由仪器、就能分辨5 Mb的单体型板块。主管Stacey Gabriel表示,释放带条形码的oligo,
测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。单体型以及其他一些有价值的长片段信息,
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。形成皮升(pl)大小的液滴,在第一个交叉,不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。”她说。实现结构变异检测和单体型分相等应用,我们还是无法轻松检出。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,试剂盒和信息学软件组成。在比对和变异检出后,多个机构已经开始使用GemCode平台,
凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,启动文库构建。我们将很快提供Linked-Reads,第二个交叉将反应包裹在油中,GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,
目前,重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,然而,