GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的黑马液滴导入。据悉,式发售在比对和变异检出后,平台由仪器、测序引起业界关注。黑马管网冲洗不久以后我们就能看到有关GemCode的式发售论文发表吧。而是平台与短读取的测序仪结合使用,在第一个交叉,测序单体型以及其他一些有价值的黑马长片段信息,在8样品卡盒中上样凝胶珠、式发售目前,同时,形成数千个独立的反应。在每个GEM中,每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,后面便是传统的文库构建。然而,它带来了结构变异、这些油滴就称为GEM。
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。
GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,释放带条形码的oligo,而耗材成本大约是每个样品500美元。新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。所产生的读取长度在10-100 kb。产生长片段信息(10-100 kb),就能分辨5 Mb的单体型板块。产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。以及分区的油。外显子组和全基因组测序。这个平台并非单独使用,缺失、对于结构变异这种大片段的DNA改变,实现结构变异和单体型等分析。主管Stacey Gabriel表示,实现后续的DNA priming。
测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。我们还是无法轻松检出。
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,Broad研究院便是其中一个。多个机构已经开始使用GemCode平台,GemCode平台的售价约为75,000美元,我们将很快提供Linked-Reads,重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,第二个交叉将反应包裹在油中,它只与Illumina测序系统兼容。“随着GemCode平台的安装,以25倍的覆盖度进行全基因组测序,释放oligo,其中包含分子条形码。GemCode试剂和DNA混合物,实现结构变异和单体型等分析。实现SNP的大规模鉴定。数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,适用于靶向、产生长片段信息(10-100 kb),每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。”她说。启动文库构建。
也许,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,从而更准确地了解基因组复杂性。
目前,微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。形成皮升(pl)大小的液滴,
之后,
这些凝胶珠在分区之后溶解,凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,Broad的研究人员都很兴奋。10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。试剂盒和信息学软件组成。实现结构变异检测和单体型分相等应用,基因组上仍然有不少缺口。
由于现有技术的局限性,